どうして人間の猿飛佐助が猿になっていたのか？その答えにもまたヤシャと荼毘の字が深く関与していた。今から一年ほど前、猿飛佐助は、真田幸村の命令で、荼毘の字のカラクリ屋に忍び込んでいた。その時、カラクリ屋にヤシャが現れ、猿飛佐助は危うく殺されかけるが、荼毘の字に救われ、猿の姿に変えられた。ヤシャは、七つ揃うとアヤカシを封じ込めることが出来るという伝説の封印魂を探索するレーダーの発明を荼毘の字に依頼していた。そして一年後、人間の姿に戻った猿飛佐助は、ムサシに一発の銃弾を手渡す。銃弾の中には、荼毘の字から託された封印魂の在処が記された秘密の地図が隠されていた。ムサシは、ロウニン、ユメ、ニンジャ太郎と、そしてカグヤはダンジョウ、猿飛佐助と共に、それぞれ別行動で封印魂を探す旅に出る決意をする。そんなムサシの前に、突如、強大なアヤカシが出現する。虎と人間のキメラ――風林火山の軍旗に、勇ましい鎧甲……彼こそは、ヤシャと荼毘の字がタッグを組んで作り出した戦国武将の魂を持つキメラアヤカシだった。そう、その戦国武将とは武田信玄！ムサシの全く新しい戦いの火ぶたが、今、始まろうとしている！
